In dieser Edition von Cluedo ist ein Schüler der Hogwarts-Schule für Hexerei und Zauberei verschwunden. Wer kann das mysteriöse Verschwinden aufklären? Die Kinder spielen als Harry, Ron, Hermine, Ginny, Luna oder Neville und versuchen herauszufinden, wer es getan hat, welcher Zauberspruch oder Gegenstand benutzt wurde und wo die Tat stattfand.
Harry-Potter-Fans werden die Eulerei, das Pokalzimmer und andere Orte der Wizarding World auf dem Hogwarts-Spielplan wiedererkennen. Wird das Hauswappen auf dem Hogwarts-Würfel gewürfelt, kann ein Rad auf dem Spielplan ein Stück gedreht werden.
Dadurch werden geheime Durchgänge und Türen enthüllt oder das Dunkle Mal erscheint. Die Spieler ziehen von Ort zu Ort in Hogwarts und grenzen dabei die Möglichkeiten ein. Sobald jemand den Täter zu kenn glaubt begibt er sich in Dumbledores Büro, um Anklage zu erheben. Ist sie korrekt, gewinnt er das Spiel.